Bildanalyse und Mikroskopie

Tabelle 3: Bildanalyse & Mikroskopie (KI generiert) 

 

 

 

 

 

 Rang 

 KI-Werkzeug 

 Link 

 Hauptanwendung 

 Kurzbeschreibung 

 

 

 

 

 1 

 nnU-Net 

 nnU-Net GitHub 

 Medizinische Bildsegmentierung 

 Sehr starkes Framework für 2D- und 3D-Segmentierung in der medizinischen Bildgebung. Häufig als Referenzstandard genutzt. 

 

 

 2 

 MONAI 

 MONAI 

 Medical Imaging AI 

 PyTorch-basiertes Open-Source-Ökosystem für Training, Validierung und Deployment medizinischer KI-Modelle. 

 

 

 3 

 Cellpose 

 Cellpose 

 Zell- und Nukleussegmentierung 

 Sehr beliebt für Mikroskopiebilder, Zellzählung, Zellmorphologie und High-Content-Imaging. 

 

 

 4 

 TotalSegmentator 

 TotalSegmentator GitHub 

 Anatomische Segmentierung 

 Automatische Segmentierung zahlreicher anatomischer Strukturen in CT- und teilweise MR-Daten. 

 

 

 5 

 StarDist 

 StarDist GitHub 

 Zellkernsegmentierung 

 Besonders stark für dicht gepackte Zellkerne, Histologie und Bioimage-Analyse.