Bildanalyse und Mikroskopie
Tabelle 3: Bildanalyse & Mikroskopie (KI generiert)
| Rang | KI-Werkzeug | Link | Hauptanwendung | Kurzbeschreibung |
|---|---|---|---|---|
| 1 | nnU-Net | nnU-Net GitHub | Medizinische Bildsegmentierung | Sehr starkes Framework für 2D- und 3D-Segmentierung in der medizinischen Bildgebung. Häufig als Referenzstandard genutzt. |
| 2 | MONAI | MONAI | Medical Imaging AI | PyTorch-basiertes Open-Source-Ökosystem für Training, Validierung und Deployment medizinischer KI-Modelle. |
| 3 | Cellpose | Cellpose | Zell- und Nukleussegmentierung | Sehr beliebt für Mikroskopiebilder, Zellzählung, Zellmorphologie und High-Content-Imaging. |
| 4 | TotalSegmentator | TotalSegmentator GitHub | Anatomische Segmentierung | Automatische Segmentierung zahlreicher anatomischer Strukturen in CT- und teilweise MR-Daten. |
| 5 | StarDist | StarDist GitHub | Zellkernsegmentierung | Besonders stark für dicht gepackte Zellkerne, Histologie und Bioimage-Analyse. |